向日葵菌核病类型菌核病主要是真菌感染，导致植株花盘腐烂，整株枯萎。常见的有两种类型：
立枯型主要发生在幼苗期。茎部出现水渍状的病斑，逐渐长出白色的絮状菌丝，空气干燥会变黑，植株逐渐枯死。发病时主要以茎部为主，叶片由下向上枯黄。
这种病主要出现在花谢之后，花盘出现病斑，花托细软呈褐色。若遇到雨天，病斑逐渐扩大，病情加重，整个花盘长满菌丝，造成腐烂。
一旦发现植株茎叶或花盘出现病斑，将植株整体拔除，以免真菌蔓延。菌核的生命力很强，会在土中存活3年，所以盆中若还有其他的植株建议换土重新种植。
药剂防治1,现蕾前喷洒1000倍的托布津溶液，喷洒1~2次。
2,现蕾及盛花期：喷洒1000倍的纹枯利溶液，主要喷洒于植株的下部及花盘背面。
3,苗期或开花期喷洒速克灵500溶液，5~10天喷洒 一次，预防效果一级棒。
4,当温度达到18~20℃，是地表撒药的最佳时期。此时将70%五氯硝基苯混合少量湿土撒于土表，可有效抑制菌核的萌发，预防效果达80%。
细菌真菌在温暖湿润的环境下极易滋生，所以控制浇水很重要。小型的盆栽品种尽量采用浸盆法浇水。家庭露地栽培尽量选用滴灌的方式，或者尽量选用细小的喷壶浇水，既节约用水，又能防止菌核病的发生。
